Mazda มีรุ่นพิเศษชื่อ 990S ให้กับ Roadster ในญี่ปุ่นหรือที่ขายในตลาดภูมิภาคอื่นรวมทั้งไทยในชื่อ MX-5 โดยรุ่นพิเศษของรถโรดสเตอร์ที่มาพร้อมกับหลังคาอ่อนนี้เน้นไปที่การลดน้ำหนักของรถและการปรับตั้งเพื่อเพิ่มสมรรถนะ รวมไปถึงมีเทคโนโลยีใหม่ช่วยควบคุมการทรงตัวของรถ
Mazda Roadster 990S เป็นรุ่นพิเศษที่ใช้พื้นฐานจากเกรด S ซึ่งใช้เกียร์แนนวลในการส่งกำลังสู่ล้อและมีหลังคาแบบอ่อนโดยที่รถมีน้ำหนักแค่ 990 กิโลกรัมซึ่งเป็นเกรดที่มีน้ำหนักเบาที่สุดของรถโรดสเตอร์รุ่นนี้ อย่างไรก็ตามเมื่อเป็นรุ่นพิเศษทางผู้ผลิตยังลดน้ำหนักของรถลงไปอีกด้วยการเปลี่ยนมาใช้ล้อฟอร์จขนาด 16 นิ้วจาก Rays ที่น้ำหนักเบาลงกว่าล้อมาตรฐานวงละ 800 กรัม
นอกจากลดน้ำหนักลงแล้วยังเสริมสมรรถนะของรถด้วยการปรับทั้งโช๊ก คอยล์สปริง พวงมาลัย และการควบคุมเครื่องยนต์โดยเฉพาะ รวมไปถึงมีระบบ KPC หรือ Kinematic Posture Control เพื่อช่วยควบคุมการทรงตัวของรถในขณะเข้าโค้งด้วยความเร็วสูง และใช้จานเบรกมีครีบระบายความร้อนขนาดใหญ่ขึ้นกว่าปกติที่ล้อหน้าร่วมกับคาลิเปอร์เบรก 4 พอดสีดำตัวหนังสือสีฟ้าเพื่อการหยุดรถ
สำหรับอุปกรณ์มาตรฐานที่มากับรุ่นพิเศษนี้มีทั้งหลังคาอ่อนสีน้ำเงินที่ภายนอกรถ กรอบช่องระบบปรับอากาศสีฟ้า/ดำ Piano Black รวมทั้งพรมปูพื้นเดินด้ายและชื่อรุ่นสีฟ้าในห้องโดยสาร ส่วนราคาของรถอยู่ที่ 2,893,000 เยนหรือประมาณ 847,000 บาท
